Jauh di bawah permukaan Southern Cross Isle, sebuah organisasi misterius yang dikenal sebagai Glittering Crux Brigade sering berkumpul di benteng bawah tanah mereka. Kelompok ini sangat tertarik dengan “Cybodies,” raksasa batu yang dapat berubah menjadi humanoid bertempur yang sangat besar, namun hanya di dunia yang dikenal sebagai “Zero Time.” Dengan menemukan dan menghancurkan segel dari empat anjing laut di pulau itu, Glittering Crux berharap dapat membebaskan diri dari Zero Time dan menggunakan Cybodies di mana pun mereka mau.
Suatu malam, seorang pemuda bernama Takuto Tsunashi terdampar di pantai pulau itu dan diselamatkan oleh Sugata Shindou dan tunangannya Wako Agemaki, salah satu gadis anjing laut di pulau itu. Setelah terbangun, Takuto dengan cepat berteman dengan keduanya dan mulai mendaftar di akademi lokal, di mana banyak dari rekan-rekan mahasiswanya yang secara diam-diam menjadi anggota Glittering Crux. Namun, Takuto menyimpan sebuah rahasia: saat berada di Zero Time, dia dapat menggunakan Cybody miliknya – Tauburn. Dalam pertempuran yang akan datang, Takuto dan Tauburn akan menjadi kunci untuk mencegah Glittering Crux menghancurkan segel Wako dan mewujudkan ambisi jahatnya.
