Hazuki Kagimura adalah seorang gadis yang canggung secara sosial dan tidak memiliki teman; dan setelah diadopsi baru-baru ini, dia juga berjuang untuk terhubung dengan keluarga barunya. Satu-satunya tempat berlindungnya dari kenyataan pahit ini adalah di antara halaman-halaman cerita, di mana imajinasinya yang hidup memungkinkannya untuk mewujudkan mimpinya tentang persahabatan dan petualangan. Namun, suatu hari, sebuah teks tua dan misterius muncul di tas bukunya. Dalam perjalanan kembali ke perpustakaan untuk mengembalikannya, Hazuki melihat seorang gadis yang tidak asing baginya, namun tidak terlihat oleh semua orang kecuali dirinya. Memutuskan untuk mengikutinya, Hazuki dituntun ke sebuah perpustakaan tersembunyi di mana sebuah dunia yang dia pikir hanya ada dalam mimpinya menunggunya.
Märchen Mädchen bercerita tentang pertemuan Hazuki dengan Shizuka Tsuchimikado, teman pertamanya, dan menemukan bahwa ia telah dipilih oleh cetakan asli Cinderella untuk menjadi penyihir yang kuat yang dikenal sebagai Origin Master. Hazuki mendaftar di Akademi Sihir Gadis Kuzunoha di mana ia belajar untuk menaklukkan ketakutannya dan percaya pada kemampuannya untuk menciptakan kisahnya sendiri yang menakjubkan.
