Sekilas, Ibara Naruse dan teman-temannya, Aoi Fukasaku dan Taeko Nomura, terlihat seperti siswa sekolah menengah yang riang gembira. Namun jalanan yang mereka lalui, tujuan mereka, dan lingkungan sekitar mereka sama sekali tidak normal. Ketika mereka terus berjalan, ketiganya menemukan diri mereka melangkah lebih dalam ke versi Tokyo yang tidak dapat dihuni, yang telah dilanda bencana nuklir 20 tahun yang lalu.
Sebagai bagian dari Dispatch 3rd Special Force Coppelion, yang dikenal sebagai tim Perawatan Kesehatan, Ibara, Aoi, dan Taeko didukung oleh Pasukan Bela Diri Darat Jepang (JGSDF) dan Kolonel Onihei Mishima saat mereka menjelajahi jalan-jalan yang sunyi dan menakutkan untuk mencari orang yang selamat. Menemukan manusia yang tersisa dan mengevakuasi mereka dengan helikopter JGSDF adalah hal yang dilakukan setiap hari oleh para gadis ini. Namun, seiring berjalannya waktu, Ibara dan teman-temannya mulai mempertanyakan kemanusiaan mereka sendiri-yaitu, bagaimana mereka bisa bertahan hidup di Tokyo tanpa alat pelindung diri.
