Suzunaru no Kirikabu Pada suatu hari di musim panas, Takashi Natsume dan teman kucingnya, Madara, berjalan-jalan untuk membeli agar-agar. Tiba-tiba sebuah truk melewati keduanya, menabrak seorang pria tua bertopeng yang meminta bantuan Natsume. Orang misterius itu ternyata adalah seorang youkai, roh dari pohon Suzunaru yang baru saja disambar petir dan ditebang. Saat pohon itu layu, youkai tersebut meminta Natsume untuk memenuhi permintaan terakhirnya: membawakannya air setiap hari hingga ia menghembuskan nafas terakhirnya.
Mugen no Kakera Tamami, seorang anak sekolah yang masih muda, menghitung langkahnya melewati hutan, mengikuti instruksi di selembar kertas. Dia berhenti untuk beristirahat dan tertidur, tetapi dibangunkan oleh seekor kucing yang berbicara aneh. Melalui pertemuannya dengan kucing dan pasangan manusianya, Natsume, ia belajar bahwa hutan memiliki dunia yang terpisah dari dunia kontemporer, di mana seseorang dapat melihat hal-hal yang tidak terlihat. Dengan menaruh kepercayaan pada keduanya, Tamami menceritakan kepada mereka tentang kisah bagaimana ia menolong seekor burung hantu putih yang muncul kembali dalam mimpinya dan menuntunnya kembali ke dalam hutan yang aneh.
