Pulau Nanae adalah pulau buatan manusia di Samudra Pasifik yang memiliki semua yang diperlukan untuk pendidikan dan pelatihan yang tepat bagi anak-anak. Pulau ini diciptakan oleh Tujuh Besar, sekelompok petualang yang dipimpin oleh Nanana Ryuugajou, sebagai tempat bagi kaum muda untuk mengejar impian mereka.
Setelah tidak diakui dan diasingkan oleh keluarganya, seorang siswa SMA bernama Juugo Yama tiba di pulau ini, dengan perasaan senang karena akhirnya bisa terbebas dari ayahnya. Saat pindah ke kamar barunya, dia menemukan hantu Nanana Ryuugajou, yang terikat di pulau ini setelah pembunuhannya yang belum terpecahkan 10 tahun yang lalu. Nanana memberi tahu Juugo bahwa, sebelum kematiannya, ia menyembunyikan benda-benda dengan kekuatan unik dan misterius di seluruh pulau – benda-benda yang dikenal sebagai Koleksi Nanana. Berharap untuk menemukan petunjuk yang akan membantunya menemukan pelaku di balik kematiannya, Juugo, dengan bantuan Tensai Ikkyuu yang memproklamirkan diri sebagai “Master Detektif” dan pembantunya yang berpakaian silang, Daruku Hoshino, memulai pencariannya.
